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        線粒體基因組測序

        來源: 本站原創    作者:佚名   發布時間:2015/3/30 16:08:03

        線粒體是真核細胞進行氧化磷酸化的場所,主要功能是提供細胞所需要的能量,線粒體擁有自身的DNA和遺傳體系,mtDNA的突變會導致一些疾病的產生,同時與生物進化及細胞起源有很密切關系,目前mtDNA 已被廣泛用于系統發育重建、譜系生物地理學、群體結構及動態和基因組水平分子進化等領域的研究。


         一、技術路線

                         

         


         二、生物信息分析

        1、標準服務:
        提供一份線粒體基因組全長序列文件(對測序數據進行組裝、去除冗余序列、序列調零)。
        2
        、升級服務:
        基因組基本分析:基因組大小、基因注釋、密碼子使用統計等
        tRNA 
        ,rRNA 二級結構預測;
        系統發育樹重構;
        序列上傳;
        其他個性化分析


        三、結果示例

          

        線粒體基因組結構圖                          rRNA二級結構預測


                    系統發育樹構建


        四、樣品要求

        1、樣品采集:鑒于線粒體在不同組織中的含量差異大,建議采樣時盡量采集線粒體含量相對較高的組織,比如肌肉組織等。 
        2
        、樣品DNA:提供濃度≥50ng/ul,總量≥5ug,并確保電泳檢測無明顯RNA條帶,基因組條帶清晰、完整。組織樣品>1.5g
        3
        、樣品保存期間切勿反復凍融。
        4
        、送樣務必標清樣品編號,管口用Parafilm膜密封。

         

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